Пептид са малим молекулима игра важну улогу у ћелијама, не само да обезбеђује хранљиве материје и поправку, већ и побољшава функције, у међувремену, има одговорност за ношење алата и материјала.
Мали молекуларни пептиди побољшавају пропустљивост средњих метаболичких мембрана (гастроинтестинална слузокожа, зид капилара, алвеоларна, менингеална мембрана, зид црвених крвних зрнаца, базална мембрана гломерула), могу ефикасно да апсорбују хранљиве материје, излучују токсине и штите од инвазије патогена.
Пептид мале молекуле обезбеђује различите аминокиселине, које могу помоћи телу да произведе ново ткиво које ће заменити оштећена ткива.